A teoria da Evolução segundo Lamarck é fundamentada em dois aspectos:
1º Haveria uma adaptação cada vez mais perfeita, um aumento da complexidade dos seres menos desenvolvidos aos mais desenvolvidos; em diferentes meios ambientes, as formas iriam tendo distantas adaptações, até originar espécies diferentes.
2ª Lei “uso e desuso” que afirma a transmissão dos caracteres adiquiridos, ocorrendo em sucessivas gerações.
Segundo a lei do uso e desuso os indivíduos perdem as características de que não precisam e desenvolvem as que utilizam. O uso contínuo de um órgão ou parte do corpo faz com que este se desenvolva e seja apto para o correto funcionamento, e o desuso faz com que este se atrofie e com o tempo perca totalmente sua função.
Lamarck acreditava que, como o ambiente terrestre sofre modificações constantes e suas alterações estruturais forçam os seres que nele vivem a se transformarem para se adaptarem ao novo meio.
O uso e desuso de partes do corpo provocam alterações no organismo do indivíduo, essas alterações podem ser transmitidas às gerações seguintes assim, o acúmulo de alterações pode levar ao surgimeno de novos grupos de seres vivos.
Alguns exemplos da teoria de Lamarck:
- Girafa: como seu alimento fica na copa das árvores, teria aumentado o comprimento do seu pescoço e das pernas pelo esforço constante de esticá-los, através de muitas gerações.
- Cobras: as cobras perderam os seus membros pelo seu desuso, porque estes atrapalhariam a locomoção em túneis estreitos
- Aves: as membranas entre os dedos das aves aquáticas resultaram do uso durante a natação. 
Aves pernaltas como as garças, teriam desenvolvido as pernas, esticando-as para manter o corpo fora d’água, em regiões inundadas.
- Plantas: as plantas de regiões desérticas teriam diminuído a superfície das folhas, para evitar a transpiração; tais folhas acabaram transformadas em espinhos. Para conservar água os caules adquiriram a consistência suculenta.
A primeira suposição da Lamarck é válida: o uso a o desuso provoca alteração nos organismos. Assim, sabemos que os atletas desenvolvem seus músculos através do uso, enquanto que a paralisação das pernas, por exemplo, determina atrofia. A falha está na segunda hipótese: caracteres adquiridos por uso e desuso nunca são transmitidos aos seus descendentes.
O golpe definitivo foi dado por Weismann, nas suas experiências cortando caudas de camundongos por sucessivas gerações a mostrando que não havia atrofia desse apêndice. Ele foi o autor da teoria da "continuidade do plasma germinativo", pela qual o germe é imortal, sendo as alterações provocadas pelo meio ambiente na soma não transmissíveis aos descendentes.
As teorias e os pensamentos de Lamarck podem ser considerados Transformistas, pois propõem a transformação e a evolução dos organismos. Suas ideias também evoluíram ao longo de seus estudos, e formaram um panorama que muito contribuiu para a biologia moderna. Seus estudos serviram de base a formulação da Teoria Sintética da Evolução no século XX.